抗微生物药物耐药性是通常随着基因变化而逐渐发生的一种自然现象。但抗微生物药物的误用和滥用会加快形成耐药性。许多地方存在对人和动物误用和滥用抗生素问题，抗生素的使用往往未获任何专业监督。例如有人使用抗生素治疗流感和普通感冒等病毒性感染，或将其用作动物的生长促进剂，或为健康动物预防疾病加以使用。 在人类、动物、食物和环境（水、土壤和空气）中，有些微生物对于抗微生物药物具有耐药性。这些微生物可以在人与动物间传播（包括以动物为来源的食品），也可在人际传播。感染控制做得不好，卫生条件不具备，以及处理食物不当，都会助长抗微生物药物耐药性的传播。